手指甲表面凹凸不平，主要有以下几种原因：

1、考虑是甲真菌病，也就是俗称的灰指甲，可以到正规医院皮肤科做真菌镜检，如果是阳性可以诊断为灰指甲，治疗应当以抗真菌治疗为主。

2、如果真菌镜检是阴性要考虑是甲营养不良，可能与平时某些微量元素缺乏有关系。还可能是甲银屑病、甲扁平苔藓，是皮肤病造成的指甲改变，治疗上也不尽相同。

3、考虑遗传史、家族史、遗传性甲病，这类指甲疾病没有特别有效的治疗方法。

4、缺铁性贫血造成的指甲表面凹凸不平，称为匙状甲，治疗上应当以补血 、补铁为主。

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